La LNB Pro A 1999-2000 fue la edición número 78 de la Pro A, la máxima competición de baloncesto de Francia.

La temporada regular comenzó el 14 de octubre de 1999 y acabó el 27 de mayo de 2000.

Los ocho mejor clasificados accederían a los playoffs, mientras que el Châlons-en-Champagne descendendió a la Pro B.

El campeón sería por novena vez en su historia el CSP Limoges, tras derrotar al ASVEL en la final en tres partidos.

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