Fue fundado el 1 de abril del año 1901 en la ciudad de Lüneburg con el nombre Lüneburger FC, cambiando a su nombre más reciente en el año 1912 y fue el equipo más viejo y exitoso de la región.

En la temporada 2005/06 estuvieron cerca del ascenso a la Oberliga, pero no lo consiguieron por el gol diferencia tras empatar en puntos con el VSK Osterholz-Scharmbeck.

[1]​ En la temporada siguiente volvieron a quedar segundos, solo que esta vez fue superado por el TuS Heeslingen.

En su última temporada con Ralf Sievers como entrenador, clasificaron a la Copa de Alemania por segunda ocasión en su historia, pero su lugar fue ocupado por el FC Hansa Lüneburger.

Manfred Harder, el entonces presidente del club y exárbitro alemán, decidió fusionar al Lüneburger SK con el Lüneburger SV para formar al FC Hansa Lüneburger,[2]​ el cual tomó el lugar del Lüneburger SK en la Oberliga Niedersachsen Ost y en la Copa de Alemania.