Pese a su escasa población, tiene la distinción histórica de ciudad comercial (købstad).
En el lugar estuvo el monasterio cisterciense de Løgum desde finales del siglo XII hasta el siglo XVI, que perteneció a la entonces diócesis católica de Ribe.
Con la secularización de las tierras del monasterio, Løgumkloster fue sede administrativa provincial.
En 1614 el duque Juan Adolfo de Holstein-Gottorp construyó aquí un palacio.
Løgumkloster fue sede de su propio municipio entre 1970 y 2007.