En 1813 Alexander von Humboldt y Aimé Bonpland volvieron de su viaje por la América equinoccial.
Definidos los objetivos, Kunth poseía muchos atributos de los que carecían Humboldt y Bonpland, pues era el típico botánico de gabinete, caracterizado por ser disciplinado, obsesivo y riguroso.
La mayoría de las nuevas especies que resultaron del viaje de Humboldt y Bonpland a las regiones equinocciales del Nuevo Mundo, han sido atribuidas a los tres naturalistas, por lo cual se citan como Humboldt, Bonpland, y Kunth, abreviado como "H.B.K.
", aunque si se tiene en cuenta el trabajo analítico y sistemático descriptivo, las publicadas en la " Nova Genera et Species Plantarum " (1823), (donde se describen 3000 nuevas especies, donde las descripciones de las especies son excelentes, y una buena parte van acompañadas de grabados hechos por F.J.
Durante este periodo, fue un prolífico autor y gran recolector de plantas.