Konohamaru es el nieto del Tercer Hokage, pero siente que es reconocido solamente por ese vínculo, no por sí mismo (en parte porque todo mundo al principio lo llamaba "Honorable Nieto" en lugar de decirle por su nombre).
Al inicio de la serie, acaba de empezar su entrenamiento en la Academia Ninja, pero ya ha intentado numerosos ataques sorpresa hacia su abuelo para poder derrotarle y ser reconocido como Hokage, todos ellos frustrados por su propia inexperiencia.
Advierte que para conseguir reconocimiento necesita entrenarse duro durante muchos años si alguna vez quiere ser líder de la aldea.
Incluso estando atrapado, Konohamaru intentó averiguar los poderes de Pain, pero su alma empezó a ser absorbida poco a poco; en ese momento, Konohamaru resultó ser un kage bushin y recordó los entrenamientos con Naruto, apareciendo de entre el humo con un Rasengan y diciéndole a Pain que él, Konohamaru Sarutobi, es un gennin nombrado como su aldea y no debía olvidarle.
Más tarde, durante la Cuarta Guerra Ninja, se ve a Konohamaru, Udon y Moegi patrullando su aldea, Udon y Moegi están muy emocionados por eso, pero Konohamaru les recuerda que no se trata de un simple juego.