[1][2] Karl Joachim era el menor de los hijos del príncipe Joseph Wenzel zu Fürstenberg y de Maria Josepha von Waldburg-Scheer-Trauchburg.
En 1787 completó su prolongada educación con un grand tour a través de Bélgica, Holanda e Inglaterra, acompañado por Joseph Kleiser.
Karl Joachim era generalmente simpatizante de la República Francesa y se piensa que se habría unido a la Confederación del Rin si hubiera vivido hasta su fundación.
[3] Incluso así, el principado sufrió con la ocupación francesa y por el paso de tropas francesas y austríacas.
El matrimonio no produjo hijos y la línea de Fürstenberg-Stühlingen se extinguió con él; Fürstenberg enteramente pasó así a Carlos Egon II de la línea subsidiaria bohemia.