Realizó sus estudios en la Universidad de Múnich, diplomándose en 1870 con una tesis intitulada Das Inulin.
Ein Beitrag zur Pflanzenphysiologie (La inulina, una contribución a la fisiología vegetal).
En 1877, es designado profesor del Instituto de Pedagogía Forestal de Aschaffenburg.
El mismo fue transferido a la Universidad de Breslavia) en 1889, donde se aseguró la dirección del jardín botánico de la Universidad.
Prantl trabajó principalmente sobre las criptógamas.