En 1924, Janoušek fue transferido a la Fuerza Aérea Checoslovaca y en 1926 se calificó como piloto de aviación.
En la Segunda Guerra Mundial, Janoušek escapó primero a Francia y luego al Reino Unido.
En el Reino Unido, comandó los escuadrones checoslovacos de la RAF, fue nombrado caballero por SM el Rey Jorge VI y finalmente ascendió a Mariscal del Aire.
En 1945, Janoušek regresó a Checoslovaquia, donde encontró que su esposa y varios de sus familiares habían muerto en prisión.
La banda de power metal Sabaton escribió una canción sobre Karel Janoušek llamada "Far From the Fame", antepenúltima canción de su álbum Heroes (2014) y fue tocada por primera vez durante el festival Masters of Rock[cita requerida] 2012 en República Checa.