Aunque su papel principal era enseñando la tecnología agrícola, Clark era un misionero laico dedicado, quien introdujo a sus estudiantes la fe cristiana por clases bíblicas.
Clark volvió a los Estados Unidos después de un año, pero Uchimura sintió su influencia por un pequeño grupo del Pacto que permanecía.
Tras cumplir su segundo bachillerato en las ciencias generales en Amherst, se matriculó en el Seminario Hartford, pero dejó después de sólo un semestre, desanimado por la educación teológica.
El incidente más notable era su negativa a arrodillarse bajamente al retrato del emperador Meiji y el Rescripto Imperial sobre la Educación en la ceremonia formal celebrada en la Primera Escuela Superior (entonces la división preparatoria de la Universidad Imperial de Tokio).
El movimiento de Uchimura atrajo a muchos estudiantes en Tokio quien más tarde serían personas influyentes en la academia, industria, y literatura.
Sus opiniones "proféticas" sobre la religión, ciencia, política, y asuntos sociales serían influyentes más allá de su pequeño grupo.
Tras su muerte, su reputación creció aún más porque sus seguidores produjeron una cantidad enorme de literatura.