Mientras atacaba Bergen, la artillería costera noruega dañó gravemente el buque y fue hundido por cazabombarderos Blackburn Skua británicos al día siguiente en su ubicación.

La torreta más a popa, que estaba situada sobre la cubierta principal, estaba desplazada a estribor para aumentar su arco de fuego, mientras que la inmediata superior lo estaba al costado de babor por el mismo motivo.

El Königsberg también llevaba cuatro soportes triples para tubos lanzatorpedos ubicados en el centro del barco y veinticuatro suministrados torpedos de 50 centímetros (19,7 plg).

[2]​[3]​ El Königsberg recibió el nombre de "Crucero B" y se le dio el nombre temporal de Ersatz Thetis, ya que estaba destinado a reemplazar al antiguo crucero Thetis.

Hubert Schmundt lo relevó y sirvió como capitán del barco durante el año siguiente.

Ese mismo año, el buque y el crucero Leipzig realizaron la primera visita de buena voluntad al Reino Unido desde el final de la Primera Guerra Mundial, dieciséis años antes.

[7]​ En 1935, se instaló en el barco una catapulta de aviones, junto con una grúa para manejar hidroaviones.

Al año siguiente, los cañones individuales de 8,8 cm fueron reemplazados por un nuevo montaje doble estabilizado triaxialmente; agregándose otros dos soportes gemelos en la superestructura trasera.

[10]​ Al comienzo de las hostilidades, el buque y varios otros cruceros alemanes colocaron un campo minado defensivo en el Mar del Norte.

Luego se dirigió al Mar Báltico para realizar maniobras de entrenamiento.

A finales de 1939 se instaló una bobina desmagnetizadora en el casco del barco.

Los impactos le provocaron graves inundaciones e incendios en las salas de calderas que cortaron la energía del barco.

Se informó que sólo un gran cañón antiaéreo estaba disparando una vez cada cinco segundos desde la popa del barco así como con armas antiaéreas más ligeras disparando desde la costa y desde barcos adyacentes aún más tarde.

Dos bombas más explotaron en el agua junto al barco; la onda expansiva abrió grandes boquetes en el casco.

Pasaron poco menos de tres horas desde el inicio del ataque hasta que el barco volcó y se hundió por completo, lo que dio a la tripulación tiempo suficiente para evacuar a una parte importante de fallecidos y heridos.

Posteriormente fue remolcado a Laksevåg (en el lado sur del puerto de Bergen) eliminando la escora.

Sin embargo, el casco sólo podía mantenerse a flote mediante un bombeo constante, por lo que fue colocado en el dique flotante de Laksevåg.