Su padre es Peter York, un ejecutivo de la discográfica Sparrow Records y un guitarrista experto, que enseñó a Justin el instrumento, como así también a su hermano Taylor York, guitarrista principal del grupo de punk rock Paramore.

Cuando era un adolescente, Justin tuvo su primera oportunidad para tocar la guitarra profesionalmente cuando Phil Joel, bajista del grupo de rock cristiano Newsboys, lo invitó a trabajar en su álbum solista.

Justin ha sido invitado en numerosas oportunidades desde entonces, tocando para músicos tales como Paul Alan, Sammy Ward, Steven Curtis Chapman, Joy Williams y Rebecca St James, entre otros.

Justin también tiene un proyecto con el grupo Cecil Adora, que incluye también a los músicos Ryan Clark, y Van Beasley.

En febrero de 2010, York sustituyó a Josh Farro durante la gira de Paramore por el Pacífico debido a que Farro planificaba su boda, y acompañó a su hermano Taylor con la guitarra y sosteniendo la segunda voz que Farro hacía en canciones tales como Emergency y My Heart.