Creció en la vieja casa familiar en el campo, cerca de Nagano.
De arquitectura tradicional, el baño estaba fuera, en un cobertizo y para hacer más cómodo ir hasta él, sus padres habían excavado un túnel subterráneo de la casa al baño.
Oscuro y habitado por grillos araña, al pequeño Ito le daba mucho miedo usarlo.
Además de Kazuo Umezu, Itō ha citado a Hideshi Hino, Furuka Shinichi, Yasutaka Tsutsui, Edgar Allan Poe y H. P. Lovecraft como principales influencias en sus obras más famosas.
En 2006, Ito se casó con Ayako Ishiguro (石黒亜矢子), otra artista de libros ilustrados, y tuvieron dos hijas.