Julián Barahona comienza su carrera a la edad de 18 años en la corporación Club Deportivo Tuluá, jugando allí 5 temporadas obteniendo un título de Liga y una Copa Libertadores.
En el 2003 comienza una nueva temporada en el Deportes Tolima consagrándose campeón de la Liga en el segundo semestre y jugando la Copa Libertadores.
Desde el segundo semestre del año 2007 jugó con el Deportivo Pereira, obteniendo regularidad y con buenas actuaciones en el campeonato colombiano.
Llega nuevamente al Deportivo Pereira a mediados de 2011 en la lucha del club risaraldense para evitar el descenso.
Actualmente se encuentra en los Estados Unidos realizando negociaciones para iniciar su propia escuela de fútbol, un sueño anhelado desde sus comienzos.