Fue encarcelado y torturado por el emperador León V el Armenio por defender el culto de las santas imágenes.

[3]​[4]​ Los datos que conocemos de Juan de Afusia no viene de un menologio griego, y fue recogida por el Cardenal Baronio cuando organizó el primer Martirologio Romano.

Según este escrito, «era abad del Monasterio de los Catharos, y en tiempos del emperador León, por su defensa de las imágenes, fue desterrado», no sin exhortar a los Padres y Hermanos del monasterio a permanecer firmes en la fe ortodoxa.

Permaneció en el exilio dieciocho meses, aprisionados los pies.

Luego fue llevado a presencia del Emperador en triunfo, pero allí no se retractó de la doctrina, y luego de soportar más vejaciones fue relegado junto con otros a la isla de Afusia, donde murió al cabo de dos años y medio de sufrimientos.