Sus obras más representativas fueron Bárbara, Henga el Cazador, Wakantanka, Tagh El Guerrero del Ocaso y New York año cero.
También creó junto a Grassi "El mundo del Hombre Rojo" que trataba de leyendas indias norteamericanas noveladas para la misma editorial.
Luego de haber leído "En busca del Fuego", obra literaria que luego se realizó la película, donde el argumento trata sobre la lucha de los humanos primitivos en la Prehistoria por el control del fuego, Zanotto se inspiró en este libro para idear Henga.
Durante su período más activo logró crear excelentes obras como Tagh El guerreo del Ocaso, New York Año Cero (Junto a Barreiro nuevamente), Wakatanka (Guion de Héctor Germán Oesterheld y luego de Carlos Albiac), Starlight, Horizontes perdidos, Falka, Penitenciario, Crónicas del Tiempo Medio y Los Cazadores del Tiempo.
Zanotto se autodefinió como un dibujante de estilo clásico-hiperrealista, muy influenciado por Alex Raymond pero forjando su propio estilo de ilustración con marcada atención al detalle, la anatomía del ser humano, paisajes, el universo y la imaginación.