[2]​ Su trayectoria futbolística se inicia en el club 'Deportivo Marcos Serrano' de Tomé,[3]​ alcanzando a jugar en la serie adulta.

En 1977, Núñez llega a Cobreloa, cuadro con el que conseguiría sus mayores logros deportivos y pasaría a la historia como el primer jugador profesional que fuera contratado por el elenco minero.

Además, el cuadro de Calama alcanzaría la final del torneo sudamericano, que perdió ante Flamengo.

En total, por Cobreloa jugó tres partidos por Copa Libertadores; ocho por liguillas y 73 por campeonatos nacionales.

Contrae matrimonio con Mónica Aguilera Sepúlveda, enlace del cual nacen Óscar Gonzalo, Vanessa Katherine y Rogelio Esteban.