Fue sucedido en el cargo de forma interina por Miguel Guijarro, y este después como electo por su hermano Carlos Padrós.

Ese año Juan Padrós recibió una medalla honorífica en la Exposición de Industrias Madrileñas.

El primer encuentro del club recién oficializado, que ya para entonces contaba con una masa social relativamente numerosa y que crecía a buen ritmo, tuvo lugar tan sólo tres días después, enfrentándose entre sí los propios socios de la entidad, divididos en dos bandos: azules y rojos.

Juan Padrós, se alineó con los primeros, mientras que su hermano fue al árbitro del partido informal.

A principios de 1904 el Madrid FC absorbió al AS Amicale y, poco después, se fusionó con el Moderno FC, tras la cual Juan Padrós abandonó la presidencia del club en favor de su hermano.

Su mandato apenas duró un año, el tiempo suficiente para conseguir la unificación del fútbol español en torno a la Real Federación Española de Fútbol, refundada en septiembre de 1913 y que mantiene continuidad hasta nuestros días.

[8]​ Citando a Juan Carlos Pasamontes, quien tuvo acceso a un manuscrito con datos autobiográficos de Padrós que se conserva en la localidad de su fallecimiento, Padrós era una buena persona, organizada, emprendedora, naturista y vegetariano.