Entre sus composiciones se destacan aquellas realizadas como bandas sonoras de películas, como Nazareno Cruz y el lobo.

En un libro sobre el Cuarteto Zupay, su hermano daría más detalles sobre su infancia y sus inicios en la música:

Compositor y director de orquesta, el maestro Juan José García Caffi realizó estudios de posgrado con los maestros Erwin Leuchter, Guillermo Gratzer, Clelia Troisi, Jacqueline Ibelz, Alberto Ginastera, Jean Fournet, Ernesto Halfter y Johan Elhert.

En ese momento el grupo se integró también con Eduardo Vittar Smith y Aníbal López Monteiro.

Con los Zupay grabó los dos primeros álbumes, Folklores sin mirar atrás, volúmenes 1 y 2, encargándose de los arreglos vocales e instrumentales.

En 1981 obtuvo en Ginebra (Suiza), el Prix de la Musique, otorgado por la crítica especializada, al músico más destacado.

También en este año se suma a la agrupación Les Luthiers para dirigir su obra sinfónica Concerto Grosso.