Juega como mediocampista central y su primer equipo fue Unión de Santa Fe.
Oriundo de Nelson, Juan Ignacio Nardoni se inició futbolísticamente en los clubes Boca y Libertad de su ciudad natal, luego se trasladó a Santa Fe para sumarse a Corinthians Santa Fe y finalmente (tras superar una prueba) terminó recalando en Unión, donde comenzó a jugar en las categorías juveniles.
[3] Poco tiempo después firmó su primer contrato profesional.
[5] En 2017 fue convocado por el entrenador Diego Placente para trabajar con la Selección Sub-15 en el predio de Ezeiza.
[6][7] En 2023 comenzó a entrenar con la Selección Sub-23 de cara al Torneo Preolímpico a disputarse al año siguiente en Venezuela.