Juan I de Etiopía
[3] Debido a la violenta controversia religiosa causadas por los misioneros católicos bajo el reinado de su abuelo Susenyos, Yohannes actuó severamente hacia los europeos.Seis Franciscanos enviados por el Papa Alejandro VII para convertir Etiopía al catolicismo donde los Jesuitas habían fallado 30 años antes, fueron ejecutados durante su reinado.Como resultado, favoreció la visita de los Armenios, cuyas creencias también abrazaban el Miafisismo, y estaban en armonía con la Iglesia etíope.Los monjes Ewostathianos de Gojjam defendían la fórmula "A través de la Uncion Cristo el Hijo fue consubstancial con el Padre", por lo que fueron conocidos como la facción Qebat ("Unción"), apoyada por n el hijo propio del Emperador, Iyasu; a ellos se oponían los monjes de Debre Libanos, que en aquel tiempo todavía defendían el tradicional Miafisismo.Wallis-Budge y H. Weld Blundell, el Emperador Yohannes fue convencido para condenar la doctrina Qebat, lo que llevó a Iyasu a intentar abandonar del reino de su padre; pero según Crummey, Yohannes favoreció la delegación Gojjame por razones políticas: en la época Gojjam era una provincia importante.