Una de sus aportaciones más famosas es su Missa in agendis mortuorum.

[1]​[2]​ Los primeros datos que arrojan las fuentes datan de abril de 1517: en estas fechas, más concretamente durante la Semana Santa, Basurto era cantor de la Catedral de Tarazona, cuyo cabildo manifestó las «superiores habilidades para el canto» de éste;[3]​[4]​ tanto fue así, que se le dotó con 1200 sueldos, cifra que ascendió hasta los 1600 sueldos (equivalentes a 100 florines de oro) en mayo de 1518.

Más tarde, en 1531, los indicios apuntan a que cantó en la capilla de Isabel de Portugal, reina y emperatriz, consorte, de España y el Sacro Imperio Romano respectivamente, al igual que otros destacados músicos como Pedro de Pastrana (1480-1559) y Bartolomé Escobedo (1510-63) al servicio de Carlos V.

Será durante su servicio a Felipe II cuando fallezca, en 1547.

La obra de Juan García de Basurto no es particularmente extensa; al contrario, tenemos constancia de muy pocas obras cuya autoría pueda ser atribuida con certeza, las cuales son: Las fuentes que recogen las obras en cuestión son: