Castillo participó en la Real Expedición Botánica a Nueva España de Martín Sessé y Lacasta.
En Nueva España, Sessé había sido seleccionado en 1787 con otros botánicos españoles por Casimiro Gómez Ortega, director del Real Jardín Botánico de Madrid.
Entre ellos Cervantes, José Longinos Martínez, y Del Castillo.
Del Castillo dejó una gran suma de dinero con destino a imprimir su proyectado libro Flora Mexicana.
Una veintena de dichos dibujos fueron publicados por el Instituto de Estudios Altoaragoneses (IEA) en la obra Homenaje a Martín Sessé y Juan del Castillo, naturalistas jacetanos del siglo XVIII.