Se consagró en el ámbito del rock argentino gracias a su álbum clásico de 1982, Tiempos difíciles.

En 1972 integra sus primeros grupos: Vía Véneto (con el que hacían cóvers) y Confidencias (de proyección folclórica).

Paralelamente trabaja algunos años animando fiestas infantiles bajo el nombre de «Juan Tolón».

Bastante tiempo después, en un reportaje concedido al periodista Marcelo Figueras decía: En 1975, forma Irreal, integrado por Daniel Wirtz (batería), Sergio Sainz (bajo), Juan Chianelli (teclados), Piraña Fegúndez (percusión y flauta) y Beto Corradini (guitarra).

Para ese entonces había armado un grupo soporte, con Silvina Garré como corista, Fito Páez como tecladista, Rubén Goldín en guitarra, Sergio Sainz en bajo y José Zappo Aguilera en batería.

Baglietto se presenta junto a Litto Nebbia, Silvina Garré y Fabián Gallardo.

Viaja a España en una gira de promoción con Celeste Carballo, Nito Mestre y Oveja Negra.

La escenografía convierte a toda la sala en un gran taller y Juan baja en una bicicleta colgada de un cable en el arranque del show.

En septiembre del mismo año, se presentó ante cien mil personas en el Monumento a la Bandera de Rosario (Argentina), como parte de los festejos por los Mil Días en Democracia, junto a Fito Páez, Silvina Garré y Antonio Tarragó Ros.

Junto a Lito Vitale encararon un proyecto musical que desembarcó en Postales de este lado del mundo, disco que incluía temas de populares autores criollos, como Carlos Gardel, Homero Manzi, los hermanos Expósito, Mariano Mores y Enrique Santos Discépolo.

Luego viaja a Los Ángeles para grabar un nuevo CD, el primero realizado fuera del país.

En 1994 presenta Corazón de barco en Córdoba, Rosario, Mar del Plata, Santa Rosa, Neuquén y Comodoro Rivadavia.

En 1998 edita "15 años", este CD fue grabado en vivo durante unos shows en el teatro Opera con un seleccionado de excelentes músicos: Pablo de la Loza - (teclados), Eduardo Rogatti - (guitarra), Sergio Sainz - (bajo), Fernando”Pepi” Marrone - (batería) y Juancho Perone - (percusión).

El álbum es una recorrida por los éxitos más importantes del rosarino con la participación de grandes figuras como Ana Belén, Lito Vitale, Fito Páez, Joaquín Sabina, Patricia Sosa, Alejandro Lerner, Virgilio Expósito, León Gieco, Julia Zenko, Adrián Abonizio, Jorge Fandermole, Lalo De los Santos.

En 1999 es citado por Lito Vitale para participar en su disco El grito sagrado junto a María Elena Walsh, Víctor Heredia, Jairo, Alejandro Lerner, Sandra Mihanovich, Pedro Aznar y Fabiana Cantilo, interpretando Mi bandera.