Según la fiscalía, Arruti participó en 14 asesinatos, de ellos diez atentados con resultado de muerte, ocho asesinatos frustrados, cinco atentados más, tres delitos de estragos, diez delitos de detención ilegal, tres robos, 11 delitos de utilización indebida de vehículo a motor, un delito de terrorismo, otro de pertenencia a banda armada, posesión de armas, amenazas, lesiones, etcétera.
Participó en los siguientes delitos: Arruti Aizpitarte fue detenido en Irún el 16 de septiembre de 1989, tras un enfrentamiento con agentes de la Guardia Civil, en la autopista Bilbao-Behovia.
Durante la operación policial murieron los etarras Juan Oyarbide Aramburu, alias Txiribitas, y Manuel Urionabarrenechea Betanzos, alias Manu.
[3] Fue trasladado a la prisión de Córdoba en 2008, poco después de que le fuese aplicada la doctrina Parot en previsión a una futura puesta en libertad.
Arruti tenía que abandonar la cárcel el 5 de marzo de 2009, pero una vez le aplicaron la doctrina Parot le alargaron su estancia en prisión otra década: hasta 2019.