Estudió Derecho, comenzando una temprana práctica como abogado en Madrid.
Fundó junto a su amigo Manuel José Quintana, también de origen extremeño, la revista Variedades de Ciencias, Literatura y Artes (1803-1805), colaboró en la Gaceta y más tarde promovió y dirigió el Diario de Badajoz (1810), para volver a colaborar con Quintana en Cádiz en la tercera época de su Semanario Patriótico.
Vuelto Fernando VII en 1814, la reacción absolutista del Manifiesto de los Persas hace que se le encarcele en Ceuta por sus simpatías liberales y allí profundizó su amistad con el también preso liberal Agustín Argüelles y diseñó y patentó un nuevo tipo de trillo que fue perfeccionado más tarde por el maestro armero y artillero Juan Francisco Gutiérrez (Correcciones al trillo inventado por Juan Álvarez Guerra, Madrid: Imp.
Vuelto a la actividad política con el Trienio liberal (1820-1823), es elegido diputado por su Extremadura natal en 1820, alineándose en las Cortes con el Partido Moderado; ya entonces era liberal doctrinario y lidera un proyecto para restringir el poder de las Sociedades Patrióticas, logrando su propósito.
Tras la restauración plena del régimen absolutista es exiliado en su villa natal.