Linares se educó primero en el Colegio Nacional Pichincha [cita requerida] y luego en el colegio seminario de la ciudad de La Plata (actual Sucre).

A la vez el mariscal de Ayacucho Antonio José de Sucre también había quedado impresionado por su excelencia académica y su talento, que logró influir para que Linares fuera nombrado profesor en el mismo colegio una vez que saliera bachiller.

Su figura pasó a la historia de Bolivia por haber sido el primer presidente civil del país y segundo gobernante civil después de Mariano Enrique Calvo.

Pues estaba muy convencido de que era preciso levantar la moral del país.

En 1857 le retiró arbitrariamente la pensión a Juana Azurduy, coronel del Ejército de Bolivia.

Apoyó la fuerza de su gobierno en la ética, con acciones implacables contra quienes transgredían la ley.

Para hacerlo se declaró dictador, aplicó severas medidas de fiscalización.