Fue el presidente del Tribunal Vasco de Cuentas Públicas hasta el año 2021.

Fue reelegido en 2007, y en este segundo mandato formó un gobierno foral monocolor (PNV) sin el apoyo de Eusko Alkartasuna.

Además, en las redes sociales mantiene un perfil público en Facebook, en el que ciudadanos afectados por los recortes mostraron su disconformidad con la decisión tomada por el diputado general.

Forma parte de los llamados jobubis -jóvenes burukides vizcaínos- que conforman «la guardia pretoriana» de Iñigo Urkullu, junto con Joseba Aurrekoetxea e Iñaki Goikoetxea -miembros del Euzkadi Buru Batzar-, Andoni Ortuzar -presidente del Euzkadi Buru Batzar y, anteriormente, del Bizkai Buru Batzar- en cargos orgánicos, o Koldo Mediavilla (miembro del EBB) y Aitor Esteban (Congreso de los Diputados en Madrid) en el flanco institucional.

José Luis Bilbao habla euskera, castellano y tiene conocimientos básicos de francés.