Actualmente está casado con Lorena Córdova Brena, con quien tiene a su hija menor del mismo nombre.

Al asumir la gubertura del Estado Diódoro Carrasco Altamirano, nombró a José Antonio Hernández Fraguas como Director General del Instituto Estatal de Educación Pública (IEEPO), dependencia encargada de la rectoría educativa en el estado.

En el 2014, entrada la reforma político-electoral, fue ratificado por su partido para continuar representándolo ante el recién creado Instituto Nacional Electoral (México).

En el 2015 Fraguas fue designado Coordinador de la Estrategia Jurídico Electoral para las Elecciones a Gobernador, supervisando los comicios en Baja California Sur, Sonora, Guerrero, Nuevo León, Colima, Campeche, Querétaro, San Luis Potosí y Michoacán.

Tras ganar los comicios electorales, Fraguas fue declarado Presidente Municipal electo, ocupando por segunda ocasión dicho cargo en su trayectoria política.