Nacido en África Occidental Portuguesa, comenzó su carrera en un equipo local, el Lusitano do Lobito, antes de firmar con el SL Benfica en 1950, equipo con el que jugó hasta 1963.
En ambas finales, jugadas contra el FC Barcelona (3-2) y el Real Madrid (5-3), Águas marcó un gol.
Fue nombrado futbolista del año en 1961, y dos años más tarde ingresó a jugar en el Austria de Viena, club en el que sólo jugó un año y nunca llegó a convencer.
No obstante, su sola presencia garantizaba el lleno absoluto de los estadios.
Segundo jugador ha tardado más de 50 años en igualarlo, Neymar Jr.