Más tarde firmaría en 2016 por el Club de Fútbol Rayo Majadahonda, donde disputaría dos temporadas.
Durante la temporada 2017-18 De Frutos fue clave en el conjunto madrileño con tan solo 21 años, tras quedar primer clasificado del grupo I de Segunda División B y conseguir el ascenso a Segunda División con el Rayo Majadahonda, eliminando al FC Cartagena en la eliminatoria por el ascenso.
[2] En la temporada 2018-19 jugó en las filas del Real Madrid Castilla, en las que obtendría 33 titularidades y lograría siete goles, convirtiéndose en uno de los jugadores más destacados del filial merengue, llegando a disputar eliminatorias por el play-off de ascenso.
En junio de 2019 fue cedido al Real Valladolid C. F. para disputar la temporada 2019-20 en Primera División.
[6] Se marchó en agosto de 2023 para regresar al Rayo Vallecano con el que también firmó un contrato por cinco años.