Su primer empleo en la administración pública fue como contador en la Municipalidad de Pehuajó en 1972.

[1]​ Con el retorno de la democracia en 1983 resultó elegido diputado nacional por La Pampa, siendo reelegido sucesivamente en 1987, 1991 y 1995.

En 1997 deja la cámara baja al ser convocado por el presidente Carlos Menem para ocupar el puesto de viceministro del Interior como segundo de Carlos Corach.

[1]​ Como ministro del Interior, Jorge Matzkin, dio instrucciones para "reordenar las elecciones internas abiertas y simultáneas" que deben hacer los partidos políticos para la designación de sus candidatos, para preparar las elecciones del año siguiente.

Matzkin realizó entre 3 y 4 disparos con su pistola Glock calibre 40, uno de los cuales impactó en la espalda del asaltante.