A los trece años debió dejar su localidad para vivir en el Valle Central e iniciarse en el fútbol en la Academia Wilmer López.

Sus dos primeros años no le fueron fáciles, ya que en ocasiones iba sin desayunar a los entrenamientos y el recurso económico de trasladarse era limitado.

Progresó en su formación para luego conformar la cantera de Carmelita hasta los diecisiete años.

Permaneció 85' minutos en cancha para ser reemplazado por Yamil Allen, donde el marcador concluyó en derrota con cifras de 3-1.

[4]​[5]​ Por otro lado, el centrocampista contabilizó cuatro partidos enfrentados y acumuló 263' minutos de acción.

Por lo tanto, su país quedó en el último lugar de la tabla del grupo B sin sumar puntos.

De acuerdo con los resultados obtenidos por su país, los costarricenses finalizaron en el cuarto puesto del torneo.

El 28 de febrero fue la primera fecha contra Santa Lucía en el Estadio Olímpico Metropolitano.

Tres días después su país volvería a ganar, siendo esta vez con resultado de 4-1 sobre Haití.

Con este rendimiento, los costarricenses se ubicaron en la zona de repechaje y el 15 de marzo se llevó a cabo el compromiso por esta definición en el Estadio Francisco Morazán, donde su conjunto tuvo como adversario a Canadá.

[30]​[31]​ Anteriormente, su país enfrentó partidos amistosos contra conjuntos argentinos y el 6 de agosto se dio a conocer que estaría en el grupo E.

Tres días después, su país tuvo el segundo cotejo contra Rusia en el mismo escenario deportivo; el empate a un gol prevaleció hasta el final.

Según los resultados obtenidos en esta etapa, su país alcanzó el segundo lugar con 4 puntos y con esto, el pase a la ronda eliminatoria.

El centrocampista fue parte integral del equipo al contabilizar las cinco presencias, con un acumulado de 311' minutos disputados.

[36]​[37]​ Dos días después, los costarricenses efectuaron su segundo compromiso, teniendo como adversario el combinado de Catar en el Estadio La Cala en Málaga.

Su combinado posteriormente viajó a Valencia, España, para la edición XXXIII del Torneo Internacional COTIF.

[45]​ En el tercer encuentro realizado el 30 de julio, su selección hizo frente a Argentina.

[48]​ Un día después se desarrolló el segundo partido, ante Eslovaquia en el Shizuoka Ashitaka Athletic Stadium, de territorio japonés.

En esa oportunidad, el centrocampista inició en la suplencia y el resultado acabó en derrota de 3-2.

En la lista de convocados que dio el director técnico Marcelo Herrera se incluyó al mediocentro.

[54]​ El primer partido fue el 19 de febrero en el Estadio Ricardo Saprissa, donde su combinado enfrentó a El Salvador.

En esta oportunidad, Martínez quedó en el banquillo mientras que el resultado concluyó con la derrota inesperada de 0-1.

Con este rendimiento, la selección de Costa Rica quedó en el segundo puesto con solo un punto, el cual fue suficiente para el avance a la Copa Mundial que tomaría lugar en Corea del Sur.

En la lista apareció el mediocampista Jonathan Martínez, siendo este su segundo torneo del mundo después de su actuación con la Sub-17 en 2015.

[56]​ En el mismo escenario deportivo tuvo lugar el segundo cotejo, dos días después, de nuevo frente a los sauditas.

[59]​[60]​ En el mismo recinto deportivo se disputó el segundo juego contra Portugal, esto tres días después.

Aunque su escuadra empezó con un marcador adverso, su compañero Jimmy Marín logró igualar las cifras, mediante un penal, para el empate definitivo a un tanto.

[63]​ El rendimiento mostrado por los costarricenses les permitió avanzar a la siguiente fase como mejor tercero del grupo C con cuatro puntos.

Para este cotejo, su nación se vería superada con cifras de 2-1, insuficientes para trascender a la otra instancia.

El único tanto de su compañero Andy Reyes al 66' marcó la diferencia para el triunfo por 1-0.