Harker es un abogado recientemente graduado de Exeter, que es designado por su empleador, el Sr. Hawkins, para actuar como agente inmobiliario para un cliente extranjero llamado Conde Drácula que desea mudarse a Londres.

[3]​ En Bistritz, Harker toma un carruaje hasta el Paso Borgo, donde a medianoche otro carruaje tirado por cuatro caballos negros lo espera para llevarlo al Castillo de Drácula en lo alto de los Montes Cárpatos.

Harker también tiene un encuentro peligroso con las tres seductoras y hermosas novias de Drácula, cuyos planes hacia él solo son frustrados por la intervención del Conde.

[6]​ Más tarde, lograría escapar, y huye a un convento, donde tendría una crisis nerviosa al llegar como resultado de su encuentro con Drácula; su prometida, Mina Murray, lo atiende en su convalecencia con la ayuda de las monjas y posteriormente se casa con él.

Jonathan Harker visita finalmente el castillo de Drácula junto con su esposa, su hijo y sus amigos supervivientes para recordar su aventura.

En Drácula, el musical, basado en el clásico personaje, escrito por los argentinos Pepe Cibrián Campoy (libro y letras), y Ángel Mahler (música), Jonathan Harker cumple uno de los roles protagónicos.

Gallen Switzerland y Graz Austria productions, Jonathan fue interpretado por el actor de musicales suizo, Jesper Tydén.

En "Drácula, el no muerto", las inseguridades de Harker sobre la relación de Mina con Drácula provocan que se vuelva un alcohólico, lo que causa un rompimiento con su esposa e hijo.