Aunque sus padres eran judíos, Carroll adoptó la ciencia cristiana, una secta que surgió en EE. UU.
Acabó la educación primaria en la escuela Loomis de Connecticut y se graduó con buen expediente en la Universidad Rutgers en 1971.
Ese mismo año contrajo matrimonio con la artista Beverly Schreiner.
Se mudó a Viena para dar clases en la American International School, y de momento sigue viviendo y trabajando allí.
Los títulos que se han publicado en castellano hasta la fecha son: Relatos: http://www.lecturalia.com/blog/2009/09/30/el-mar-de-madera-de-jonathan-carroll/