Jon Flanagan (Liverpool, Inglaterra, Reino Unido, 1 de enero de 1993) es un exfutbolista británico que jugaba como defensa.
Aún formando parte del equipo sub-18 del Liverpool F. C., hizo su debut con los reservas en marzo de 2010 contra el Hull City A. F. C. Debido a su rendimiento en el equipo de reservas, al comienzo de la temporada 2010-11 apareció por primera vez como titular en el torneo Lancashire Senior Cup con triunfo sobre el Oldham Athletic A. F. C. Posterior fue escogido como integrante en el once ideal de las reservas por el diario deportivo The Times.
[2] Tras unos meses sin equipo, en noviembre firmó con el Royal Charleroi S. C. belga hasta final de temporada con opción a prorrogar su contrato un año más.
[3] En julio de 2021 se marchó a Dinamarca para jugar en el HB Køge, equipo que en ese momento era entrenador por su excompañero en el Liverpool F. C. Daniel Agger.
Actualizado al final de su carrera deportiva.