John era el hijo mayor, tuvo dos hermanos, Prudence y Justin.

Tuvieron tres hijos: Marcella, que, murió pronto, a consecuencia de una vacuna infectada, Worth, artista e ilustrador y Richard "Dick" Gruelle.

Las muñecas Raggedy Ann y Raggedy Andy que diseñó Gruelle y los recuerdos relacionados se han convertido en artículos de colección.

En noviembre de 1929, el New York Herald Tribune lanzó "Brutus", una tira cómica con elementos fantásticos en la que Gruelle continuó trabajando hasta su muerte en 1938.

Tras la muerte, su viuda, inició acciones legales para asegurar los derechos de sus obras, registros y patentes.