Anteriormente jugó con los Cincinnati Reds, San Francisco Giants, Chicago White Sox y los Kansas City Royals, equipo con el cual ganó la Serie Mundial de 2015.

Cueto estuvo en las ligas menores durante tres temporadas, y se destacó en muchos niveles.

[1]​ Más tarde fue promovido de nuevo a Sarasota Reds, donde terminó su temporada para el segundo año consecutivo.

El jonrón fue el único hit que permitió, ponchando a 10 en siete innings.

También fue el primer lanzador de Grandes Ligas que tuvo 10 ponches y 0 base por bolas en su debut.

Fue el tercero en la historia de la MLB en tener 10 ponches y permitir sólo un hit.

Su ratio de bases por bolas por cada nueve entradas bajó, mientras que en la temporada 2009 subió.

Lanzando contra los Filis de Filadelfia, fue bombardeado; permitió nueve carreras limpias en cinco hits, dando 3 boletos.

Muchas personas han comparado este giro con el del famoso Luis Tiant.

Cueto permitiría dos carreras más, y fue retirado después de 3.1 entradas.

Los Rojos mostrarían poca resistencia el resto del juego, y los Piratas ganaron por 6-2, avanzando a una serie Serie Divisional con otro rival de división, los Cardenales de San Luis.

Bateó un sencillo remolcador y Aroldis Chapman salvó el juego en la novena.

[14]​ Eventualmente los Reales ganaron la serie, otorgándole a Cueto su primer anillo de campeón.

"Pedro ha sido mi inspiración, la persona por la que decidí dejar de jugar los jardines para convertirme en un lanzador", dijo Cueto.

"Uno de mis mayores sueños es conocer a Pedro en persona, darle la mano y decirle que ha sido mi héroe y mi modelo a seguir".

[19]​ Johnny Cueto participó en el Clásico Mundial de Béisbol 2009 representando a la República Dominicana.

Tuvo una victoria para la República Dominicana en el Grupo D, el juego 3 de la primera ronda.