Durante los años 1760 Walker publica artículos en Scots Magazine y en Philosophical Transactions.

Después de muchas deliberaciones, Walker gana y comienza como profesor en 1779, manteniéndose hasta su deceso en 1803.

En la segunda parte del año avanzaba en los tres reinos naturales: minerales, vegetales, y animales.

En toda su carrera científica mantuvo su investidura de reverendo, y en 1790 es elegido Moderador, su máxima posición.

A fines de los años 1790, comienza a perder la vista, y varias de sus clases las da Dr Robert Jameson, un médico y estudiante que ya había estudiado en el continente europeo.

John Playfair, Sir James Edward Smith, Sir James Hall, Mungo Park, Robert Waring Darwin, Robert Brown, Thomas Beddoes, Thomas Charles Hope, y Samuel Latham Mitchell.