John Thomas Quekett (Langport, 11 de agosto de 1815 - 1861) fue un botánico, microscopista, e histólogo inglés.
Su hermano Edwin John Quekett (1808-1847) cuya contribución a los mismos campos de la investigación tuvieron una menor notoriedad.
Su hermano mayor William Quekett, fue rector y autor.
Quekett estudió medicina en el Hospital de Londres en 1831.
Su nombre fue commemorado por John Lindley en el género brasileño de orquídea: Quekettia, que contiene numerosos cristales microscópicos.