Su tío, Charles Dominique Joseph Bouligny, había servido durante un período como senador de los Estados Unidos por Luisiana en la década de 1820 y su abuelo, Francisco Bouligny, era un funcionario colonial español de alto rango y gobernador militar a finales del siglo XVIII en la Luisiana española.

[1]​[2]​ Se involucró con la política en el movimiento Saber Nada en la década de 1850 y en 1855 era secretario del partido en el estado.

[4]​ En contraste con el partido nacional, el Partido Americano de Luisiana se negó a adoptar una prueba religiosa para la membresía,[5]​ haciéndolo acogedor para los ex Whigs pro esclavitud, antiinmigrantes, incluidos los criollos católicos como Bouligny.

[8]​ En las elecciones presidenciales de 1860, apoyó públicamente al candidato demócrata Stephen A.

[12]​ Una vez que se aprobaron las elecciones, Bouligny se postuló para la reelección a su Congreso, pero fue fácilmente derrotado por Benjamin Flanders que tenía el respaldo del gobernador militar de la Unión de Luisiana, Benjamin Butler.