Allí conoció al miembro de la facultad Harold H. Nelson, quien lo introdujo en jeroglíficos y en 1923 para el famoso egiptólogo James Henry Breasted.
Se le ofreció por medio de Breasted una beca en el Instituto Oriental, donde obtuvo su doctorado en 1926.
[1] Tenía muchos honores que le fueron encomendados por varias universidades y sociedades, incluyendo: D. Lii.
A través de un benefactor el John A. Wilson Professorship of Oriental Studies se inauguró en 1968.
En su cumpleaños número setenta, exalumnos y colegas le regalaron un libro, Estudios en Honor de John A. Wilson (1969).