A pesar de su corta vida, Zinn realizó una contribución muy importante al conocimiento anatómico.

En su libro Descriptio anatomica oculi humani, nos ha legado la primera descripción detallada y comprensiva de la anatomía del ojo humano.

Durante este período sus mayores trabajos y esfuerzos científicos fueron en el campo de la Botánica.

Zinn describió en 1757 al género de orquídeas Epipactis de la familia Orchidaceae.

Su recuerdo perdura por los términos anatómicos Zonula ciliaris Zinnii y en la Circulus arteriosus sclerae = "Círculo arterial de Zinn-Haller" o anillo de Zinn Las cinias plantas oriundas de México, fueron traídas a Europa en 1753.