Era el padre del naturalista Carl Heinrich Ebermaier que escribió sobre herbología.
Se formó en la academia quirúrgica en Braunschweig, luego estudió medicina en la Universidad de Gotinga.
Posteriormente, se trasladó a Kleve, donde fue nombrado miembro del consejo medicinal prusiano.
Más tarde trabajó con la misma capacidad en Düsseldorf.
Con Georg Wilhelm Christoph Consbruch (1764-1837), publicó Allgemeine Encyclopädie für practische Ärzte und Wundärzte (Enciclopedia general para médicos y cirujanos 1803.