En 1997 comenzó a trabajar para Ultimate Fighting Championship (UFC) como entrevistador y comentarista.

[4]​ A los diecinueve años, ganó un torneo del US Open Championship como peso ligero.

[7]​ Rogan no tenía la intención de ser cómico profesional y al principio se planteó seguir una carrera en kickboxing.

[13]​[14]​ Él era un gran aficionado a la comedia en su juventud y sus padres lo llevaron a ver la película del cómico Richard Pryor Live on the Sunset Strip, que le afectó "de una manera increíblemente profunda.

[16]​[7]​ Mientras trabajaba en su número, Rogan ejerció varios trabajos enseñando artes marciales en la Universidad de Boston y Revere, Massachusetts, repartiendo periódicos, conduciendo una limusina, en la construcción y ayudando a un investigador privado.

[5]​ Rogan ha citado a Richard Jeni,[18]​ Lenny Bruce,[19]​ Sam Kinison y Bill Hicks como influencias cómicas.

[4]​ La aparición provocó que la cadena le ofreciera un contrato exclusivo por tres años y un papel en un episodio piloto de un "concurso tonto" por $500.

[13]​ Sobre esta época, Rogan comenzó a actuar en The Comedy Store en Hollywood y se convirtió en un habitual pagado por el propietario Mitzi Shore.

El cambio hizo que Rogan trabajara con los guionistas antes del estreno de la serie para ayudar a desarrollar su personaje,[21]​ que luego describió como una "versión censurada y muy atontada" de sí mismo.

[25]​ Se había interesado por el jiu-jitsu en 1994 tras ver pelear a Royce Gracie en UFC 2: No Way Out, y consiguió el puesto en la organización porque Sussman era amigo de su cocreador y productor original Campbell McLaren.

[26]​ Se retiró después de unos dos años, ya que su salario no le daba para cubrir el coste del viaje a los eventos, que en aquella época se realizaban en lugares rurales.

[7]​ Rogan ganó el Premio Wrestling Observer Newsletter por Mejor Presentador de Televisión dos veces, y fue nombrado Personalidad del Año de MMA cuatro veces en los World MMA Awards.

En esta época, Rogan también trabajó en ideas para una película y una serie de dibujos con su amigo cómico Chris McGuire, y comenzó a escribir un blog en su sitio web JoeRogan.net, que usó para discutir varios temas que le ayudaron a desarrollas sus monólogos.

El programa aumentó la presencia nacional de Rogan e hizo crecer la asistencia a sus espectáculos cómicos.

Dos meses más tarde, utilizó el dinero que ganó por presentar Fear Factor para grabar su segundo especial de comedia Joe Rogan: Live en Phoenix, Arizona.

Rogan contrató a un equipo de cámara para documentar sus giras que publicó en su sitio web para su webserie Joe Show.

Un video del incidente fue subido a YouTube e incluyó pruebas y comentarios de otros cómicos, incluyendo George Lopez, "El Reverendo" Bob Levy, Bobby Lee y Ari Shaffir.

Rogan fue el presentador del breve programa de CBS Game Show in My Head, que se emitió durante ocho episodios en enero de 2009 y fue producido por Ashton Kutcher.

Accedió a presentar el programa ya que la idea le intrigaba, calificándolo como "una forma de entretenimiento completamente descerebrada".

En diciembre de 2009, Rogan lanzó un podcast gratuito con su amigo y colega comediante Brian Redban.

El podcast presenta a una serie de invitados que hablan sobre sucesos actuales, opiniones políticas, filosofía, comedia, pasatiempos y muchos otros temas.

Se interpretó a sí mismo en Here Comes the Boom, otra comedia de acción protagonizada por Kevin James estrenada en 2012.

Rogan se interesó en jiu-jitsu brasileño después de ver a Royce Gracie pelear en UFC 2: No Way Out en 1994.

En 1996, Rogan comenzó a entrenar jiu-jitsu bajo Carlson Gracie en su escuela de Hollywood, California.

Rogan se crio como católico, después de haber asistido a la escuela católica en primer grado, pero desde entonces no sigue ninguna religión organizada y se identifica como ateo agnóstico.

Es muy crítico con la Iglesia Católica y, basándose en sus experiencias como antiguo miembro, cree que es una institución de opresión.

Rogan no está afiliado a ningún partido político, pero ha sido descrito que tiene opiniones principalmente libertarias.

Rogan apoya el uso legalizado del cannabis y cree que tiene numerosos beneficios.

Rogan se opone a la circuncisión infantil rutinaria y ha afirmado que faltan pruebas científicas significativas sobre los beneficios de la práctica, que considera no completamente diferente de la mutilación genital femenina debido a su naturaleza no consensual.

Ha declarado que sus experiencias personales con la meditación en tanques de aislamiento lo han ayudado a explorar la naturaleza de la conciencia, así como a mejorar el rendimiento en diversas actividades físicas y mentales y en el bienestar general.