João Costa se crio futbolísticamente en el F. C. Porto desde categorías inferiores, quemando todas las etapas en los equipos filiales del conjunto portugués hasta llegar al primer equipo, con quien realizó varias pretemporadas, además de ser internacional con Portugal desde la sub-15 hasta la sub-20.
Para la temporada 2018-19 se hizo oficial su cesión al F. C. Cartagena para competir en Segunda División B de España durante dicha campaña cedido por el Fútbol Club Oporto.
[4] Se marchó al expirar su contrato, habiendo estado el último año entrenando con el primer equipo pero sin ficha.
[6] Quedó libre al finalizar la misma y, aunque tuvo una oferta para continuar, regresó a Portugal para jugar en el C. D.
[7] Allí estuvo hasta enero de 2025, momento en el que se unió al C. F. Estrela da Amadora.