[3]​ Después de interpretar, durante unos seis años, distintos roles frente a la cámara, Soffer decidió centrarse en sus estudios, es por eso que se inscribió en la Academia The Gunnery, un internado ubicado en Connecticut.

[6]​ Soffer interpretó a un fugitivo que se vuelve policía en la película para televisión From the Mixed-Up Files de Basil E. Frankweiler.

En 1998, Soffer fue elegido como integrante del elenco regular en la serie Two of a Kind.

Después de cuatro meses en el programa, abandonó temporalmente la actuación para centrarse en sus estudios.

Soffer hizo su regreso a la pantalla grande en el largometraje independiente Gracie de Davis Guggenheim.

Jesse Lee Soffer ha actuado como invitado en varias series de televisión, como CSI: Miami, The Mentalist y en Rizzoli & Isles.