En la especie J. prima la mandíbula superior carecía de dientes, mientras que la inferior tenía tres, mientras que la especie J. palmapenis tenía dientes en la parte media de la mandíbula superior, aunque no en la frontal.

Las extremidades superiores eran más largas que las inferiores, y presentaban una fuerte musculatura alar.

Su número exacto no se puede determinar debido al deterioro de las mismas durante la fosilización.

Existe otro espécimen, referido como LPM 0193, que fue considerado como un género y especie nuevos, Shenzhouraptor sinensis, aunque seguramente sea un sinónimo de J. prima.

Otro espécimen también fue nombrado como otra especie, Jixiangornis orientalis, la cual también se considera sinónimo de Jeholornis.

Shenzhouraptor sinensis fue descrito en julio de 2002 por Ji et al., en el mismo mes que Zhou y Zhang describieron Jeholornis prima en la revista Nature.

Su reducido tamaño, junto con la forma de la cabeza del animal, sugieren una dieta especializada en semillas.

[4]​ Otros especímenes encontrados, clasificados como ejemplares juveniles, poseían más dientes, aunque se indica que al madurar los perderían.

[4]​ Una de las adaptaciones que apoyan la hipótesis es la presencia del hallux revertido, como en las aves modernas.