En 1792 pasó al servicio público bajo la administración del General Dumouriez.
Expulsado en 1795, fue restaurado en el cargo por Lucien Bonaparte, durante cuya época sirvió como secretario en la prefectura del Alto Marne.
Boissonade dedicó principalmente su atención a la literatura griega tardía: Las Anecdota Graeca (1829-1833) y Anecdota Nova (1844) son importantes para la historia bizantina y los gramáticos griegos.
Una selección de sus ensayos fue publicada por Ferdinand Colincamp, Critique littéraire sous le premier Empire (1863), vol.
I, conteniendo una lista completa de sus obras, y una Notice Historique sur Monsieur B. fue publicada por Joseph Naudet.