Por su gran campaña al frente del equipo albo, el Químico fue nombrado Director Técnico de la Selección Colombia de Mayores, para dirigirla en la Copa América Paraguay 1999 y las eliminatorias para el Mundial Corea/Japón 2002.

[2]​ En el torneo continental, llevado a cabo en territorio guaraní, Colombia clasificó holgadamente en el primer lugar de su grupo, al acumular nueve puntos de nueve posibles.

Pero en la temporada 2002, los resultados del Químico al frente de la escuadra caldense no fueron positivos.

No obstante, fue desvinculado del club unos meses después por malos resultados.

Tuvo un breve paso por las oficinas del Deportes Tolima en enero de 2020.