Ese mismo año marcó también dos goles en Liga: otra vez ante Uniautónoma, en una victoria 3-1, y ante Huila, en un partido que Junior ganó por 4-3.

El primer semestre de 2016 sirvió para que Jarlan Barrera siguiera consolidándose como titular importante en Junior.

Junior terminaría siendo subcampeón ese año, perdiendo la final con Medellín, con Jarlan como titular en ambos partidos.

Ya en el segundo torneo del año, Barrera encontró más regularidad y fue una pieza importante en la campaña de Junior en Liga, Copa Sudamericana y Copa Colombia, torneo en el que marcó el primer gol de la final que Junior le ganó 2-0 a Medellín para coronarse campeón de este certamen por segunda vez en su historia.

Pues este habilidoso futbolista costeño no renovó su contrato con el elenco 'tiburón' y se fue, por ende, sin dejarle ni un solo peso al club del que su primo segundo 'El Pibe' Valderrama es considerado un ícono.

En enero, fue eliminado por Deportes Tolima en la Copa Colombia 2020, siendo Jarlan Barrera de los más resistidos por el hincha verde.

Realizó un partido histórico en Montevideo ante Nacional de Uruguay donde marco doblete en el histórico 4-4, y siendo fundamental en la inolvidable remontada ante Libertad en segunda fase, incluso llegando como uno de los favoritos a ganar la Copa Libertadores 2021,por el buen juego del equipo, según la prensa argentina y brasileña.

Todo fue decepcionante cayo eliminado ante la Equidad en cuartos de final en un global 3-2, esto dejando como resultado la salida del entrenador verdolaga Alexandre Guimaraes.

Los verdolagas en el finalización terminaron primeros con 42 puntos haciendo un récord de 10 partidos sin perder ni recibir gol.

En diciembre de 2021 fue eliminado por Deportivo Cali en cuadrangulares, así causando decepción en la hinchada verde.

Las riendas del club fueron tomadas por Hernan Dario Herrera entrenador con el cual Jarlan Barrera siguió siendo suplente, perdiendo la tiularidad por completo, mostrando mejor nivel Giovanni Moreno, Andrés Andrade y Yeison Gúzman.

En enero de 2015 volvió a ser convocado, en esta ocasión para formar parte del equipo que jugó el Sudamericano Sub-20.